Наукові конференції України, VIII МН-ПК молодих вчених і спеціалістів "СЕЛЕКЦІЯ, ГЕНЕТИКА ТА ТЕХНОЛОГІЇ ВИРОЩУВАННЯ СІЛЬСЬКОГОСПОДАРСЬКИХ КУЛЬТУР"

Розмір шрифту: 
ОЦЕНКА МОЛЕКУЛЯРНОЙ ВАРИАБЕЛЬНОСТИ ДВУХ ГЕНОВ, КОДИРУЮЩИХ ДЕГИДРИНЫ ПШЕНИЦЫ
П. В. Кузмицкая, О. Ю. Урбанович

Остання редакція: 2020-04-20

Тези доповіді


Белки дегидрины первоначально были охарактеризованы как растворимые белки, экспрессия которых индуцируется дегидратацией. Однако позже было показано их участие в защите растения и при наступлении других неблагоприятных условий: (холода, засоления и др.). В зависимости от наличия и числа консервативных доменов их разделяют на несколько типов: YSK2, SK3, Kn и КS. Известно, что экспрессия дегидринов является одним из компонетнов системы защиты растений от абиотического стресса. Целью данной работы было изучение вариабельности нуклеотидных последовательнсотей двух генов, кодирующих дегидрины пшеницы. Один из них относится к типу K-2, другой - K-3 (соответственно, ТaDHN18 иТaDHN19.3 по классификации Wang et al.). Интерес к данным локусам обусловлен участием этих генов в защите растения от воздействия различных неблагоприятных абиотических факторов.

Полиморфизм локуса ТaDHN18 исследовали на примере 6 сортов пшеницы, среди которых были яровые и озимые сорта с разной устойчивостью к холоду. Были сиквенированы полноразмерные последовательности генов. Анализ их выравнивания показал, что исследуемый локус в геномах различных сортов пшеницы характеризуется высокой консервативностью. Об этом свидетельствует степень идентичности последовательностей, кодирующих открытую рамку считывания, колеблющаяся в пределах 97,52 – 100%. Причем все обнаруженные мутации представляли собой однонуклеотидные замены.

Изучение молекулярной вариабельности локуса ТaDHN19.3 проводили на 6 сортах пшеницы, среди которых были яровые и озимые сорта с разной устойчивостью к холоду. Анализ выравниваний нуклеотидных последовательностей открытых рамок считывания, кодирующих дегидрины ТaDHN19.3, показал их высокую консервативность. Степень идентичности колебалась в пределах 98,23 ‑ 100%. Сравнение нуклеотидных последовательностей генов ТaDHN19.3, выделенных из геномов пшеницы различного генетического происхождения, показало присутствие точечных мутаций. Все они являлись однонуклеотидными заменами, инсерций и делеций обнаружено не было. Трансляция открытых рамок считывания и анализ последовательностей гипотетических белков показали, что их степень идентичности колеблется в пределах 96,43 – 100%.

Таким образом, при выполнении данной работы была показана высокая консервативность отдельных дегидринов К-2 и К-3 типов из генома пшеницы.

Исследование поддержано грантом БРФФИ Б18Р-166 и РФФИ №18-54-00026.